
前言
上一期我(wo)(wo)們從(cong)理(li)論和實際例子(zi)角度介(jie)(jie)紹(shao)了BOIN設(she)計(ji)在(zai)臨床研究中的作(zuo)用,以及其相對于傳統3+3設(she)計(ji)的優勢。本期,我(wo)(wo)們簡要介(jie)(jie)紹(shao)如何借助(zhu)各種軟件來計(ji)算獲(huo)得我(wo)(wo)們使(shi)用BOIN作(zuo)為(wei)臨床試驗設(she)計(ji)過程(cheng)中需要的參數(shu)以及其他數(shu)據。
要獲得設計參數以及相關的數據,首選使用安德森癌癥研究中心推出的線上的BOIN suite網站。網址為//trialdesign.org/one-page-shell.html#BOIN,下面我們簡要的(de)介紹如(ru)何進行(xing)操(cao)作:
(1)首先我們可以利用Trial Setting選項卡填寫劑量組數目,起始劑量級別,每隊列人數,總隊列人數,單劑量組最大入組人數這幾(ji)個基礎參數(shu),這些數(shu)據(ju)應通過前(qian)期對藥物本(ben)身毒性及(ji)特(te)性的了(le)解進(jin)行(xing)選擇(ze)。
(2)下(xia)一步(bu)即可設(she)定(ding)目標毒性(xing)概(gai)率,應綜合考慮藥(yao)(yao)物毒性(xing)及收益風險(xian)關(guan)系。如果藥(yao)(yao)物在低劑量組下(xia)被認為是安全的(de),可以選(xuan)擇(ze)使用(yong)(yong)加速滴定(ding)的(de)設(she)計。如果選(xuan)擇(ze)的(de)隊列(lie)人數為3和6的(de)話,也可以選(xuan)擇(ze)合并(bing)使用(yong)(yong)3+3設(she)計,這樣可以與傳統設(she)計更加契合,并(bing)且保留了BOIN設(she)計的(de)優勢。
(3)最(zui)后則是設置毒(du)性(xing)(xing)劑量剔除標準,即Pr>Pe(真毒(du)性(xing)(xing)概率>目標毒(du)性(xing)(xing)概率的(de)(de)概率>Pe),一般我(wo)們把Pe設置為0.95。對(dui)于(yu)低(di)劑量組(zu)的(de)(de)毒(du)性(xing)(xing)被認(ren)為是顯著的(de)(de)藥物來說,可(ke)以選擇(ze)使用更加嚴格的(de)(de)剔除標準,避(bi)免(mian)首個劑量組(zu)已經超過MTD。另一方(fang)面,我(wo)們也(ye)可(ke)以選擇(ze)確保MTD下的(de)(de)DLT概率小(xiao)于(yu)我(wo)們的(de)(de)劑量降(jiang)低(di)界值,這一選項會提(ti)高(gao)試驗(yan)的(de)(de)安全性(xing)(xing),但(dan)是可(ke)能會稍微降(jiang)低(di)MTD的(de)(de)選擇(ze)比例(selection percentage)。
全部(bu)設(she)置完后,即可獲(huo)得設(she)計(ji)的流程圖(tu)及決策表(biao)
如果(guo)選擇了(le)更加嚴(yan)格的(de)(de)第一劑(ji)量組(zu)剔除規則(ze)的(de)(de)話(hua),還會(hui)得到一個試驗終止決策(ce)表:
我們(men)還可(ke)以(yi)通過(guo)Simulation選(xuan)項卡,模擬(ni)在不(bu)同“真”毒(du)性(xing)概率(lv)下(xia)(xia)的(de)(de)試驗(yan)參數,并且我們(men)可(ke)以(yi)同時(shi)模擬(ni)3+3設(she)計(ji)下(xia)(xia)MTD組入組人數及選(xuan)擇比例與BOIN設(she)計(ji)的(de)(de)差異,更(geng)(geng)加直觀的(de)(de)了解兩者的(de)(de)差異性(xing)。網(wang)站基于前面填入的(de)(de)目(mu)標毒(du)性(xing)概率(lv)會自動隨(sui)機生成5個不(bu)同的(de)(de)“真”毒(du)性(xing)概率(lv)情景,我們(men)也(ye)可(ke)以(yi)手動更(geng)(geng)改。
模擬結束后,我們可以得(de)到如下(xia)的表格供(gong)參考。
完成上面(mian)兩個選(xuan)項(xiang)卡的操(cao)作后,網站(zhan)在Trial Protocol選(xuan)項(xiang)卡中提供(gong)了自動生成的試驗方案模板和流程圖供(gong)參(can)考。
當試驗全部完成后,我(wo)們(men)可(ke)以(yi)通過Select MTD選項卡,輸入(ru)我(wo)們(men)試驗獲得(de)(de)的數(shu)據(ju),從而得(de)(de)到一個(ge)不同劑(ji)(ji)量(liang)水平(ping)下MTD的選擇概率(lv)。如下圖所示(shi),第(di)三劑(ji)(ji)量(liang)水平(ping)的DLT概率(lv)最為(wei)接近我(wo)們(men)的目(mu)標(biao)毒性概率(lv),故MTD為(wei)第(di)三劑(ji)(ji)量(liang)水平(ping)。
此工具還有(you)桌(zhuo)面(mian)軟(ruan)件的版本,與在線(xian)版幾乎一致,由于軟(ruan)件可及性(xing)的問題,建議使用(yong)在線(xian)版本。
考慮到使用(yong)R語(yu)言的門(men)檻。此處僅(jin)為簡要介紹。
第一步獲得遞增減少界值,我們可以利用 get.boundary()函數
第二步我們可以像在網上操作那樣,通過模擬預測試驗的一些參數,使用get.oc()函數。
可(ke)以發現許多(duo)參數與上面的(de)(de)get.boundary()類似(si),這(zhe)里不再多(duo)說,僅介紹下(xia)特有的(de)(de)參數:
同(tong)時我(wo)們(men)也可以使(shi)用(yong)summary()或plot()去(qu)獲得和(he)網頁(ye)版類似的表格和(he)圖(tu)表。
當完成試驗后,可以通過select.mtd選擇我們的MTD:
與(yu)上(shang)面類(lei)似,可使用summary()或plot()去(qu)獲得和網頁版(ban)類(lei)似的表(biao)格和圖表(biao)。
BOIN資源(yuan)包(bao)中同時也(ye)包(bao)括了設計BOIN comb的函(han)數。使(shi)用R進行操作可能(neng)會增(zeng)加(jia)難度,但對于有經驗(yan)的R語言(yan)用戶來說,這種方(fang)法可以與其他R資源(yuan)包(bao)結合,使(shi)得(de)整個操作過(guo)程更(geng)加(jia)的靈活。加(jia)小編微信討論或獲(huo)取BOIN資源(yuan)包(bao)手冊。
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